Findings from allele-specific PCR
While I was in Edinburgh, the graduate student partially sequenced the acetylcholinesterase gene from resistant strains and identified resistance-associated mutations at three amino acid sites. If this type of resistance allele had been the only one present in the Katsunuma population, in addition to the susceptible allele, then the resistance-associated point mutations at these three sites would have been present at equal frequencies within the population. Although I was able to establish only a limited number of lines, I performed allele-specific PCR using isofemale lines of D. melanogaster newly collected in Katsunuma, and several fascinating findings emerged.
(translated version of the post on November 06, 2021)
対立遺伝子特異的PCRから見えてきたこと
私がエジンバラに滞在していた間に、大学院生が部分的に塩基配列を分析した抵抗性系統のアセチルコリンエステラーゼには、3つのアミノ酸サイトに抵抗性型の変異がありました。感受性型の対立遺伝子の他に、このタイプの抵抗性型の対立遺伝子しか勝沼集団には存在していないのであれば、これら3つのサイトにおける抵抗性型の点突然変異は、集団内において等しい頻度で存在しているはずです。ごくわずかの系統数しか確立できませんでしたが、勝沼で新たに採集して作製したキイロショウジョウバエの1雌由来系統を用いて対立遺伝子特異的PCRを行ったところ、いくつか興味深いことがわかりました。
(2021年11月6日のポストを再掲）