Even more interestingly, I found that the frequencies of resistance-associated point mutations were not identical across the three amino acid sites. As mentioned earlier, if only the resistant and susceptible alleles used by the graduate student in her analyses had been present in the Katsunuma population, the frequencies of resistance-associated mutations at each site within the population should have been the same; however, in fact, they differed. This suggests that, in addition to alleles carrying resistance-associated mutations at all three sites, as detected by the graduate student, the Katsunuma population may also contain a low frequency of alleles with point mutations at only one or two of these sites.
(translated version of the post on November 06, 2021)
さらに興味深いこととして、抵抗性型の点突然変異の頻度が、これら3つのアミノ酸サイトの間で同一ではないことがわかりました。上で述べたように、もし大学院生が分析に用いていた抵抗性型の対立遺伝子と感受性型の対立遺伝子しか勝沼集団に存在していないのであれば、それぞれのサイトにおける抵抗性型の変異の集団内における頻度は同じになるはずでしたが、実際には異なっていました。つまり、大学院生が検出したような3つのサイトに抵抗性型の変異を持つ対立遺伝子だけではなく、3つのサイトのうちの1つ、あるいは2つのサイトにしか変異を持たない対立遺伝子も勝沼集団にはわずかに存在している可能性が示唆されたわけです。
(2021年11月6日のポストを再掲)